O jogo segue a história de Resalin Stout, uma garota que mora na Ilha Kurken em busca de aventura. Em um dia de verão, ela encontra um barco a remo abandonado e se aventura no continente com seus amig...
Ryza vive dias pacatos na vila de Rasenboden, cercada por um enorme lago. Em busca de emoção para sua vida, ela convida seus amigos de infância, Lent e Tao, e propõe fugir da ilha em busca de aventura.
Ryza recebe de Empel a missão de sintetizar um remédio, e o primeiro passo é encontrar os ingredientes necessários para a receita. Enquanto a jovem alquimista vasculha a ilha em busca dos itens, Tao e Lent se dedicam à sua própria maneira ao crescimento pessoal, orientados pelos dois misteriosos estrangeiros.
Depois de ajudar uma aldeã idosa com seu remédio feito com alquimia, Ryza fica determinada a encontrar uma flor incomum que a aldeã se lembra de ter visto quando jovem. Lila acompanha o grupo em mais uma excursão para longe da ilha em busca da flor misteriosa.
Ryza, Lent e Tao recebem a missão de investigar uma mina de cristais fora da ilha. Lent fica encarregado de manter a segurança da equipe, enquanto Ryza procura um minério raro e Tao observa e analisa os arredores. Mas a missão - que aparenta ser simples - ensinará duras lições aos jovens aventureiros.
Após a bronca que levaram por causa dos erros na expedição da Mina Submersa, Ryza e seus amigos estão muito estressados e ansiosos. Preocupada com eles, Klaudia, Lila e Empel bolam um plano para ajudá-los a aliviar a tensão.
Ryza decide construir um esconderijo na clareira segura da floresta, e recruta a ajuda de todos os seus amigos para cuidar do trabalho braçal de transportar material e erguer a construção. Enquanto isso, para ajudar seus amigos a concluir o esconderijo, Klaudia lança mão de seus talentos de... confeiteira?!
Inspirada pela dedicação de seus amigos, Klaudia decide tomar coragem e mudar de vida. Ela começa um regime de treinamento de arqueria, orientada por Lila, e pede a seu pai permissão para se aventurar pelo mundo com seus amigos... Mas seu pai não vai conceder esse direito sem receber um ótimo argumento em troca.
Sr. Moritz apresenta a Ryza e seus amigos o segundo teste: limpar o detrito e entulho de uma das praças da ilha. Apesar das toneladas de material que precisam ser retiradas, as crianças têm apenas uma semana de prazo, e terão de ser bastante criativos com sua alquimia para conseguir impressionar a todos!
Sr. Lubart decidiu qual será o último teste que avaliará se Ryza e seus amigos são boa companhia para sua filha Klaudia. Neste desafio, os aventureiros terão que competir contra Bos e seu capanga em uma corrida fora da ilha, enfrentando perigos e mistérios... Mas um acontecimento repentino colocará em risco não apenas o teste, como também a vida de todos os envolvidos.
Com a presença do dragão ameaçando as rotas de comércio e o abastecimento da ilha, Sr. Moritz decide organizar uma expedição de caça à besta alada, e Bos se voluntaria para fazer parte dela. Preocupados com a ameaça dracônica e o bem-estar do jovem rabugento, Ryza e seus amigos decidem se preparar para ajudar a expedição a obter sucesso em sua jornada.
Ryza e sua equipe descobrem uma maneira de chegar ao Castelo Meteoro antes de Bos e sua equipe de expedição. Armados de novas armas e novo conhecimento, eles se preparam para enfrentar a maior ameaça que já encararam em sua carreira de aventureiro.
Ryza e seus amigos encontram por acaso um fragmento de uma tabuleta de pedra, que indica a possível existência de um tesouro! Sem pensar duas vezes, a turma mergulha em uma busca por pistas que vai atravessar toda a ilha de Kurken!
