A história do anime revolve em torno de Yakumo Saitou, um estudante universitário que nasceu com olhos de cores diferentes. Seu olho esquerdo vermelho lhe concede a habilidade de ver e comunicar-se co...
Depois de visitar um prédio abandonado, uma das amigas de Haruka Ozawa parece estar possuída por um espírito, e outro comete suicídio. Em desespero, ela vai até Yakumo Saitou, um estudante universitário indiferente que há rumores de ter habilidades sobrenaturais.
Durante a noite, dois construtores estão trabalhando numa construção perto de um templo para seu chefe, o presidente Irie, quando veem um fantasma. Haruka, no seu trabalho de meio período ouve sobre a maldição de uma raposa branca que tem assombrado o templo de Kunimatsu.
Yakumo assume um caso sobre a morte de um garoto de uma escola e Haruka conta a ele sobre uma experiência que teve quando um colega do trabalho a levava para casa de carro e passaram por um túnel que dizem ser assombrado. Yakumo está convencido que só pode ver espíritos, mas nada mais, e por isso não pode ajudá-los o tempo todo. Yakumo também leva em consideração a vida das pessoas ao seu redor (especialmente a de Haruka) que ele está colocando em perigo.
Depois de parar para ajudar um homem caído na rua, Hijikata Makoto (uma repórter e filha do chefe de polícia), é possuída pelo espírito do homem quando ele falece. No dia seguinte, Haruka é convidada por uma garota para investigar a morte de uma estudante chamada Ayaka. Enquanto Yakumo é solicitado por Gotou para investigar a possessão de Hijikata como um pedido do chefe.
Ayaka é filha do Dr. Kinoshita que morreu durante um tufão e se afogou no rio. O médico também era próximo do Dr. Andou Takashi (o fantasma que possui Hijikata Makoto). Gotou e Yakumo acabam encontrando provas que conectam o Dr. Kinoshita a Andou a partir de uma foto nos pertences de Andou.
Yakumo e Haruka investigam a assombração de um apartamento alugado por um estudante universitário, Date Shota. Eles então iniciam uma investigação para descobrir o que assombra o local.
O detetive Gotou pediu a ajuda de Yakumo para investigar um vídeo de um suposto fantasma feito na Mansão Nanase, onde 4 membros da família Nanase foram assassinados há 15 anos. O vídeo foi obtido por Hijikata Makoto e filmado pelo roteirista Hoshin Yukiko. Yakumo percebe algo e sai para investigar por conta própria depois de assistir ao vídeo.
Yakumo e o detetive Gotou ainda estão desaparecidos. Makoto e Yuutarou entram em contato com Haruka e conversam com o tio de Yakumo, Isshin, sobre encontrar Yakumo.
Ishii finalmente descobriu a identidade de Miyuki como a mulher que estava junto ao pai de Yakumo. Depois de conversar com a antiga professora dela, Ishii e Hijikata encontram o detetive Gotou em uma sala secreta dentro da Mansão Nanase, com uma pequena ajuda de Takeda.
Haruka e Yakumo acompanham a mãe de Haruka até a estação de trem. Ela diz a eles que enviará algo, mas eles não ouviram o que, pois a porta do trem já estava fechando enquanto ela lhes contava. Enquanto isso, Hijikata Makoto está conversando com um médico em um hospital, que diz a ela que um fantasma aparece e pergunta aos pacientes "quando você vai morrer?". Hijikata promete retransmitir este caso para um especialista que ela conhece (Yakumo).
Gotou e Ishii correm para o santuário para proteger Isshin. Enquanto isso, Haruka e Yakumo vão ao hospital para investigar o fantasma da garota.
Haruka e Yakumo veem o fantasma da garotinha sobre Isshin e decidem segui-lo. Em seguida, Yakumo se afasta de todos e parece estar investigando algo.
O tiro de Miyuki tinha um objetivo: gerar ódio dentro de Yakumo para que o espírito de seu pai pudesse tentar uma possessão. Miyuki explicou que o objetivo de atrair Yakumo para abraçar a escuridão é garantir que seu estado de espírito seja praticamente o mesmo de seu pai, permitindo que seu pai e sua alma se fundam e que seu pai assuma seu corpo.
