Uma detetive da polícia de Boston e uma médica legista combinam suas habilidades e talento para resolver os assassinatos. Talvez suas personalidades muito diferentes fazem a relação entre a detetive J...
A detetive Jane Rizzoli e a médica-chefe legista Dra. Maura Isles investigam o terrível assassinato de um casal rico. O M.O. combina com o trabalho de um serial killer conhecido como Cirurgião, que uma vez quase assassinou Jane. Agora que o Cirurgião está atrás das grades, parece que um de seus protegidos está retomando de onde ele parou.
As tensões estão altas quando o esquadrão investiga um possível imitador do lendário Estrangulador de Boston... ou poderia ser o próprio Estrangulador de Boston? Enquanto isso, Jane bate de frente com seu novo chefe, o tenente Grant, que por acaso é do mesmo bairro onde Jane cresceu. E Maura tem problemas com seu hábito de diagnosticar todo mundo.
Jane e Maura investigam a misteriosa morte de um menino cuja família é de Cabo Verde. Parece a princípio que ele pode ter morrido durante uma tentativa de exorcismo, e pode levar uma mensagem do além-túmulo para Jane identificar exatamente o que aconteceu. Jane se distrai com o caso quando sua mãe marca um encontro surpresa para ela.
Depois que uma estudante é morta a tiros em plena luz do dia, a investigação revela que ela tinha mais do que alguns segredos. Enquanto isso, a mãe e o pai de Jane brigam por causa do carro.
O irmão mais velho de uma família “Brâmane” de Boston (descendentes diretos de passageiros do Mayflower) é encontrado morto no porto após um aparente acidente de navegação. Mas a estreita ligação de Maura com a família e o ressentimento de Jane pela riqueza que exibem ameaçam inviabilizar a investigação. Angela, enquanto isso, tenta vender uma bebida saudável da polinésia.
Jane e Maura investigam o que parece ser um crime de ódio, a agressão brutal e o assassinato de uma mulher saindo de um bar lésbico. Com Jane disfarçada, eles esperam atrair o assassino a céu aberto. Fora do trabalho, Maura bancar a cupido da Jane com um belo instrutor de ioga.
A Maratona de Boston se transforma em uma cena de crime quando um atirador começa a mirar nos corredores. Correndo para pegar o assassino antes de outro tiroteio, Jane e Maura devem conduzir sua investigação em segredo para não causar pânico em massa.
Jane já foi sequestrada e quase morta pelo serial killer preso Charles Hoyt. Agora, um corpo encontrado em um parque tem todas as indicações de ser obra dele. Jane deve fazer o possível para manter seu medo desse homem sob controle enquanto Maura tenta entrar na mente do assassino.
Uma investigação leva Jane ao passado conturbado de Boston quando um ladrão de identidade é assassinado; Maura parte em uma busca pessoal.
Depois que um policial disfarçado trabalhando em uma armação de contrabando de narcóticos é morto a tiros, os assassinos voltam seus locais para a sede de homicídios de Boston, deixando Jane, Maura e Frankie Jr. presos em uma luta pela sobrevivência em seu território. É uma situação que forçará Maura a se desafiar como nunca antes. Em casa, os pais de Jane estão animados com o fato de seu filho mais velho, Tommy, ser libertado depois de cumprir pena na prisão.
Depois de levar um tiro no final da temporada durante um cerco à delegacia, Jane Rizzoli é homenageada como uma heroína em um evento público. A celebração é de curta duração, no entanto, quando ocorre um desastre. O caso que se seguiu reúne Jane com uma antiga paixão do ensino médio, o sargento Major Casey Jones, que pode ser a pessoa que ela precisa para curar suas cicatrizes emocionais.
O dia relaxante de Jane e Maura em um spa ao ar livre acaba quando elas descobrem o assassinato de uma mulher grávida servindo como mãe de aluguel. Logo começa a caçada para encontrar os pais biológicos do bebê.
Pouco depois de os marinheiros invadirem as ruas de Boston para a Semana da Frota, uma jovem é encontrada morta. O pai de Frost, um Almirante da Marinha, chega à cidade, causando tensão com seu filho. E, Maura vai a um encontro com o mecânico de Angela.
Quando a filha de um policial é sequestrada na frente de seu irmão mais novo, Jane e a equipe correm para encontrar a garota, temendo que seu sequestro esteja ligado a outro caso em que uma jovem apareceu morta apenas algumas horas antes.
Jane e Maura investigam depois que o técnico do time de beisebol Boston Pilgrims é encontrado morto no vestiário. A morte veio com um craque e os donos da equipe lutando pelo controle da equipe. Enquanto isso, o irmão de Jane, Tommy, volta para casa depois de ser libertado da prisão.
Uma reencenação da Guerra Revolucionária torna-se a cena de um verdadeiro assassinato quando um soldado aparece morto. O amplo conhecimento de Maura sobre a história americana torna-se importante quando ela e Jane tentam resolver o caso. E a brilhante mãe de Maura, Constance Isles, vem a Boston para uma exposição de arte.
Jane e a equipe investigam o que parece ser uma caça às bruxas moderna em Salem. Enquanto isso, a antiga namorada de Frankie volta à cidade com uma surpresa, e Jane não tem nenhum problema em falar o que pensa sobre a situação.
Jane e Maura investigam o passado de uma família quando um homem é morto; Jane suspeita que Maura esteja escondendo algo.
Quando um jovem estivador é encontrado morto, a equipe descobre que há conexões com a máfia; Jane tenta evitar o treinamento de sensibilidade; Maura começa a passar tempo com o irmão de Jane.
Um assassino serial afirma ter pistas sobre o assassinato de outro prisioneiro; Frankie Jr. se prepara para fazer o exame de detetive.
O tiroteio de um ativista comunitário traz uma testemunha que está disposta a testemunhar. O apresentador de TV Bill O'Reilly exibe sua desaprovação ao departamento de polícia.
A Homicídios de Boston se une ao FBI depois que um gerente de banco é baleado durante um assalto. O irmão de Jane, Tommy, pode estar enfrentando mais problemas assim que seu relacionamento com Maura começa a crescer.
Jane vai à reunião do ensino médio e leva Maura para o passeio, mas a diversão é interrompida quando um de seus antigos colegas aparece morto no campo de futebol. Jane deve se concentrar no passado quando percebe que todos em sua classe são suspeitos em potencial.
O mundo da dança competitiva se torna mortal quando a mãe de uma estrela é esfaqueada até a morte em uma competição. Jane e a equipe procuram pistas, mas logo percebem que algo está errado na história da mulher.
Quando um incêndio em um armazém mata um bombeiro, Jane e Maura devem investigar se foi um incêndio criminoso ou um acidente. Mas a investigação encontra um obstáculo quando um atropelamento deixa alguém no hospital.
