Dana Scully e Fox Mulder são dois agentes do FBI que investigam casos não solucionados, estranhos e inexplicáveis que envolvem fenômenos paranormais.
A agente especial Dana Scully é designada para trabalhar com o agente especial Fox Mulder, validando o trabalho dele em um projeto especial chamado "Arquivo X", que reúne os casos não resolvidos do FBI.
Mulder e Scully vão para a base da Força Aérea em Ellens para investigar o caso misterioso de um piloto de testes militar que desapareceu depois de apresentar um comportamento estranho e psicótico.
Um dos amigos de Scully, da época em que ela fazia a academia do FBI, pede sua ajuda na investigação de estranhos casos de assassinato, em que as vítimas tiveram seus fígados arrancados.
O caso de uma menina que desaparece do trailer onde mora com sua família faz com que Mulder acredite que ela tenha sido raptada por alienígenas, tal como aconteceu com sua irmã Samantha.
Os agentes investigam a morte de Roger Crockett, um homem desabrigado, que foi atacado e devorado numa floresta.
Mulder e Scully investigam estranhos assassinatos cometidos por uma força invisível que protege uma jovem.
Um computador descontrolado começa a matar pessoas, para preservar sua própria existência.
Mulder e Scully, juntamente com um pequeno grupo, ficam presos no Ártico depois das inesperadas mortes dos membros de uma equipe de pesquisadores que trabalhava na região.
Mulder e Scully são contatados por um especialista em comunicações da NASA, que mostra para eles evidências de uma sabotagem em um programa espacial.
Uma nave não identificada cai na cidade de Townsend, Wisconsin, fazendo com que o governo coloque a área em quarentena.
Dos homens, cada um morando em um canto do país, são encontrados mortos no mesmo dia em seus quintais, sem nenhuma gota de sangue nos corpos.
Mulder e Scully unem forças com um inspetor da Scotland Yard, quando um homem com poderes pirotécnicos assusta membros da aristocracia britânica.
Scully acredita nas premonições psíquicas de um condenado à morte, que parecem ser a única esperança para que os agentes consigam prender um perigoso assassino.
Um membro de uma seita religiosa capaz de mudar de sexo se torna o principal suspeito em uma onda de assassinatos.
O espírito de um perigoso criminoso se apossa de um agente do FBI, que já foi namorado de Scully.
Um criminoso que teria morrido na prisão anos antes inicia uma vingança contra Mulder.
Mulder e Scully se tornam o alvo de uma campanha de difamação quando tentam investigar o transporte secreto de uma forma de vida alienígena realizado pelo governo.
Os agentes investigam uma paróquia liderada por um homem cujo filho possui o poder de curar - ou matar - com um simples toque de sua mão.
Os agentes procuram uma criatura semelhante a um lobo, descrita em uma lenda dos nativos americanos.
Um grupo de lenhadores trabalhando em uma floresta remota desenterra milhares de criaturas mortais semelhantes a insetos que paralisam suas vítimas e depois tecem seus casulos ao redor delas.
Eugene Tooms, que Mulder ajudou a colocar na prisão, é libertado em condicional.
Uma garotinha de oito anos é a principal suspeita de uma série de mortes bizarras e aparentemente não correlacionadas.
Quando importantes cientistas de um laboratório de pesquisas aeronáuticas morrem em circunstâncias misteriosas, os agentes suspeitam que um zelador mentalmente perturbado possa de alguma forma ser o culpado.
Garganta Profunda dá informações a Mulder sobre um caso extremamente importante que envolve um fugitivo desaparecido e a clonagem de vírus extraterrestres.
Mulder corre para fazer com um óvni que pousou antes que a equipe do governo acoberte tudo.
Mulder e Scully perseguem uma nova ameaça - um assassino com mutações genéticas que vaga pelos esgotos de Nova Jersey.
Ao investigar uma série de assassinatos em uma pequena cidade, os agentes descobrem que utensílios cotidianos estão sendo usados para matar.
Mulder e o novo parceiro, Alex Krycek, lidam com um fuzileiro que não consegue dormir. É possível que ele tenha a habilidade de matar com seus sonhos.
Durante as negociações de uma tensa situação envolvendo reféns, Mulder simpatiza com o criminoso armado, que afirma ter sido vítima de experimentos alienígenas.
Quando Scully é abduzida por forças invisíveis, Mulder inicia uma desesperada busca por ela, se frustrando com uma inesperada traição.
Durante as investigações de um série de assassinatos ritualísticos, Mulder se envolve com uma linda suspeita, que pode ser uma vampira.
Enquanto Scully, em coma, luta para sobreviver, Mulder encontra provas da abdução dela e confronta o Homem Fumante.
Mulder e Scully são perseguidos por uma nova forma de vida assassina que invadiu os corpos de uma equipe de pesquisadores vulcânicos.
Ao investigar um culto religioso em área rural, os agentes descobrem um sinistro experimento envolvendo adolescentes violentos e DNA alienígena.
Quando uma droga experimental liberta espíritos atormentados em uma casa de repouso, Mulder e Scully enfrentam fantasmas assassinos.
Os agentes ajudam uma grávida perseguida por um serial killer que parece ter herdado geneticamente memórias assassinas.
Com a vida de Scully em jogo, Mulder persegue um profanador de cadáveres, cujas obsessões podem levar ao assassinato.
Mulder e Scully correm risco de se tornarem sacrifícios humanos ao descobrir um culto satânico comandado por um substituto demoníaco.
Ao investigar uma série de mortes em um campo de refugiados haitianos, os agentes se deparam com um xamã vodu vingativo que pode ser capaz de fazer os mortos se levantarem.
Durante a investigação dos assassinatos de três médicos idênticos, Mulder faz uma descoberta impressionante sobre sua irmã desaparecida. A vida de Scully é ameaçada por um caçador de recompensas.
Em busca do terrível caçador de recompensas que sequestrou Scully, Mulder descobre os planos de um alienígena de colonizar a Terra.
Fêmeas de animais exóticos do zoológico são abduzidas e ficam prenhas, em um caso que Mulder acredita estar ligado a uma conspiração alienígena.
Presos em um "navio fantasma", Mulder e Scully precisam desvendar o mistério por trás de uma força sobrenatural que acelera o envelhecimento.
Os agentes entram no mundo bizarro de artistas de espetáculos quando uma criatura invisível começa a matar os habitantes de uma cidade circense.
Mulder e Scully são expostos ao antigo ritual de exorcismo enquanto investigam um garoto possuído por forças do mal.
Os agentes vão atrás das grades para impedir um vírus horrivelmente desfigurador que está matando reclusos em uma taxa epidêmica.
Mulder e Scully perseguem um cientista desequilibrado cuja pesquisa fez com que sua sombra se tornasse mortal.
Enquanto investigam assassinatos em uma cidade ao sul, os agentes encontram indícios da existência de um canibalismo moderno, com ligações com a vida eterna.
Mulder e Scully descobrem uma conexão assustadora entre um acobertamento sobre a existência de óvnis e experimentos secretos do governo.
Enquanto a agente Scully enfrenta uma possível demissão por parte do FBI, prepara-se uma caçada para encontrar o agente Mulder, que está desaparecido. Scully, a pesar de tudo, tenta descobrir sua localização, convencida de que ainda está vivo.
Mulder retorna enquanto a caçada ainda está em andamento. Guiados por uma velha fotografia de seu pai e um grupo de científicos, os agentes descobrem mais do que podem imaginar em um antigo depósito de West Virginia. A verdade pode ser mortal.
Os agentes investigam a morte de vários jovens, que foram aparentemente alcançados por um raio na mesma e pequena cidade. Também, um adolescente descobre que possui incríveis poderes elétricos após sobreviver a ser atingido por um raio.
Alguém está assassinando psíquicos de vários tipos. Um leitor de folhas de chá, outro de cartas de tarô e outro de palmas são as vítimas aparentes de um assassino em série. Mulder conhece Clyde Bruckman, quem pode ser um psíquico verdadeiro.
Após o condenado a morte, Napoleão 'Neech' Manly, ser executado na cadeira elétrica em Florida, vários guardas são vítimas de horríveis assassinatos. Há boatos na prisão sobre uma lista de assassinatos com cinco nomes.
Os agentes irão a Cleveland para investigar uma estranha morte. Foram encontrado os restos de uma mulher, mas seu corpo está em avançado estado de decomposição. Mulder acredita que o assassino usa salas de chat para atrair suas vítimas.
Victor Stans tentou se suicidar várias vezes, mas sempre falha e afirma: 'Ele não me deixa morrer'. Diz ver a sombra ou o contorno de um soldado que o tortura. Os agentes descobrem que sua família morreu em um incêndio.
Investigam o caso de Amy Jacobs, de 15 anos, sequestrada de seu quarto durante a noite. Ao mesmo tempo, Lucy Householder colapsou no trabalho. Ambas têm sangramento do nariz e a polícia descobriu que Lucy foi sequestrada.
Mulder compra um vídeo de uma 'autopsia alienígena' e apreende um diplomático japonês que possui documentos sobre vagões utilizados como laboratórios rodantes. Scully conhece várias mulheres que revelam informação sobre seu desaparecimento.
Mulder fica preso a bordo de um trem equipado com um dispositivo explosivo após encontrar o vagão que contém o equipamento científico. Scully procura a verdade por trás da relação entre o governo e experimentos secretos.
Os agentes investigam a morte de um evangélico que afirmava possuir as feridas de Cristo na cruz. Mulder sabe que aconteceram outras mortes similares, mas depois conhece Kevin Kryder, de 12 anos, que aparentemente apresenta esses sinais.
O agente Mulder vai a uma cidade que parece ser atacada por baratas assassinas. Ao descobrir a existência de um experimento local em andamento, Mulder encontra a entomóloga envolvida. Porém, a resposta reside em outro experimento.
Os agentes investigam várias mortes de crianças da mesma escola. A cidade está alterada e culpa uma seita satânica. Mulder visita um astrólogo local que revela um alinhamento planetário estranho, que afeta dois adolescentes.
O FBI prende o assassino em série John Mostow, responsável pela morte de 7 homens. Mostow afirma ter sido possuído por um espírito. Enquanto é custodiado, acontecem ataques similares e Mulder acredita que Mostow pode dizer a verdade.
Os agentes investigam o caso da tripulação de uma nave francesa, em que todos os homens, exceto um, sofrem queimaduras por radiação. Mulder está interessado porque a nave funcionava no que ele acredita ser o local do acidente de um OVNI.
Enquanto o subdiretor Skinner está no hospital, Mulder descobre mais pistas sobre os segredos do governo envolvendo uma entidade alienígena e uma aeronave afundada da segunda guerra mundial. Scully persegue o homem que assassinou sua irmã.
Scully e Mulder investigam uma série de mortes catalogadas de suicídios. Robert Patrick Model confessou ser o culpado por telefone e o FBI tenta prendê-lo. Quando conseguem, o carro em que está sofre um acidente de trânsito.
Uma maldição cai em um grupo de arqueólogos após escavar uma urna sagrada na América do Sul e transportá-la para um museu de Boston. Enquanto os agentes continuam a investigação, o Departamento do Estado considera se deve devolver as relíquias.
Ao trabalha com o detetive Glen Chao, que fala chinês, Mulder descobre uma pista quando encontra peças de dinheiro do diabo, usado como oferenda simbólica. Isso os leva a um jogo mortal entre imigrantes recém chegados, necessitados de dinheiro.
O renomado autor Jose Chung está escrevendo um livro sobre a abdução alienígena de um casal investigado pelos agentes Mulder e Scully. Scully lhe oferece a maior parte da informação sobre o caso, porque Mulder não está disponível.
Prestes a se divorciar, o deprimido subdiretor Skinner conhece Carina Sayles no bar de um hotel e decidem passar a noite juntos. Ao acordar no outro dia, Carina está deitada a seu lado, morta e com o pescoço quebrado.
Mulder suspeita que uma besta similar ao monstro do Lago Ness é responsável pela morte de várias pessoas que moram perto de um grande lago. A última vítima é um guarda-florestal. Scully é afetada pelo 'monstro' de uma maneira muito pessoal.
Os agentes investigam uma série de assassinatos relacionados com um dispositivo que pode alterar sinais de televisão e infundir paranoia no receptor. Isto é confirmado quando Scully encontra Mulder fazendo piadas e rindo com o Canceroso.
Os agentes investigam um tiroteio em um restaurante de comidas rápidas envolvendo um homem que pode curar com suas mãos e também mudar sua aparência a qualquer momento. Enquanto investiga, Mulder descobre que sua mãe teve um infarte.
O agente John Doggett lidera o FBI em uma caçada para localizar Mulder, enquanto Scully e Skinner usam as informações dadas pelos Pistoleiros Solitários na busca para encontrar o colega deles.
Enquanto procuram o desaparecido Gibson Praise, Scully, Skinner e Doggett encontram o caçador de recompensas alienígena que muda de forma para enganar o FBI.
Scully e Doggett investigam uma série de assassinatos, supostamente de um meio-morcego / meio-humano.
Scully fica presa em Utah e é raptada por um culto que insere um parasita na espinha dela.
Um garoto de oito anos reaparece após ter sido sequestrado dez anos antes - mas ainda tem apenas 8 anos.
Um advogado acorda na prisão e descobre que sua vida está se voltando no tempo desde que assassinou a esposa.
Doggett investiga a suposta capacidade do líder de um culto de se projetar nos sonhos das vítimas, e Scully vai para o hospital.
Scully e Doggett investigam um assassino com visão de raios X.
Um jovem sucateiro está lentamente virando metal após se expor a resíduos perigosos e resolve matar os responsáveis.
Doggett e Scully investigam uma série de assassinatos bizarros e suspeitam de um místico que resolve vingar a morte do filho.
Doggett investiga o último Arquivo X no qual Mulder estava trabalhando antes de sumir: um monstro que cura pessoas, digerindo-as e regurgitando-as sem a doença.
Trabalhando contra o tempo, Doggett e uma equipe de especialistas tentam resolver o mistério por trás de estranhas mortes em um túnel do metrô de Boston.
Scully teme que ela e outras mulheres grávidas deem à luz bebês alienígenas.
A agente Monica Reyes se junta a Scully, Doggett e Skinner na busca por Jeremiah Smith após um OVNI depositar os corpos de abduzidos na Terra.
Depois do enterro de Mulder, o corpo de um abduzido volta à vida, dando esperança a Scully e Skinner.
Após um funcionário do censo dos EUA tentar alertar a Casa Branca de uma invasão alienígena, Mulder resolve acessar dados armazenados em um complexo de processamento de informações.
Os agentes procuram alguém que pode ter relação com a morte do filho de Doggett anos antes: um homem que pode estar possuído pelo próprio mal.
Mulder e Doggett ficam presos em uma plataforma de petróleo cuja tripulação foi infectada com o misterioso vírus do petróleo.
Mulder e Scully devem salvar Doggett e seu parceiro "verde" de um cientista que se transformou num monstro-réptil.
Imparável, Billy Miles começa a matar cientistas que realizam pesquisas genéticas - e Scully vira o próximo alvo.
Quando se descobre um elo entre Billy Miles e membros do FBI, Mulder procura por respostas; Scully e Reyes encontram refúgio em um local remoto enquanto Scully se prepara para dar à luz.
Enquanto Doggett enfrenta dificuldades em sua investigação sobre o vice-diretor Kersh, os agentes encontram uma linda mulher que possui a habilidade de permanecer debaixo d'água.
Doggett tenta descobrir a verdade sobre uma mulher com poderes sobre-humanos que está ligada de alguma maneira a experimentos científicos que estão sendo realizados em um navio da 2ª Guerra Mundial.
Os agentes tentam encontrar uma ligação entre o paciente de um hospital psiquiátrico e bizarros assassinatos satânicos.
Reys sugere que um assassino que feriu gravemente Doggett pode ter vindo de uma dimensão paralela.
O crânio de um adolescente se quebra depois de uma acrobacia idiota. Mas a verdadeira causa foi... Moscas, que aparentemente o devoraram por dentro.
Scully faz amizade com um casal que acredita ter um bebê que possui as mesmas características extraterrestres que o bebê William, e um agente sinistro convence Scully a tentar tirar Mulder da reclusão.
Agente Doggett acorda em uma corrupta e violenta cidade mexicana sem se lembrar de sua verdadeira identidade.
Reyes sente que, de algum modo, ela desempenhou um papel em uma série de macabros assassinatos ocorridos há mais de um século – em que todas as vítimas foram esfoladas vivas.
Quando um culto religioso que opera no Canadá desenterra uma espaçonave parecida com a que Scully descobriu na África, tem início um plano para matar o bebê William.
Enquanto Scully tenta desesperadamente encontrar seu filho, membros de um culto religioso se preparam para entrar em uma espaçonave que eles acreditam abrigar uma manifestação física de Deus.
Depois de sofrer um acidente de carro, agente Reyes se encontra presa em um submundo entre a vida e a morte – e sua única esperança de sobreviver é uma funcionária de hospital que pode transitar entre os dois mundos.
Quando provas de DNA exoneram um assassino que Doggett ajudou a capturar 13 anos antes, Doggett tenta desesperadamente colocá-lo de volta na cadeia antes que ele ataque novamente.
Quando Reyes usa numerologia para conectar os assassinatos de várias mulheres, ela e Scully ficam presas com um misterioso jogador de xadrez que pode ser o assassino.
Um garotinho está no centro de um caso que envolve estranhas criaturas que aparentemente se refugiam dentro do corpo humano.
Quando os Pistoleiros Solitários vão ao socorro de Reyes e Doggett em um caso que envolve Morris Fletcher e um supersoldado, eles se envolvem em uma jornada para encontrar Yves Adele Harlow.
Os agentes prendem um homem cheio de cicatrizes que foi pego invadindo o escritório do Arquivo X e tentam determinar sua verdadeira identidade... Doggett acredita que esse homem seja Fox Mulder.
Um cadete do FBI com um misterioso instinto para solucionar crimes lança nova luz sobre o assassinato não solucionado do filho de Doggett.
Os agentes tentam "ligar os pontos" quando uma série de estranhas mortes estão conectadas a um homem que mora em uma casa que é uma réplica exata da casa da série de TV "The Brady Bunch" - inclusive com os próprios personagens.
Depois de ser acusado de matar Knowle Rohrer, Mulder é julgado pelo Exército dos EUA – e ouve o depoimento de um grupo de testemunhas de defesa que apoiam a alegação de Mulder sobre uma conspiração do governo e a existência de vida extraterrestre. Com a ajuda dos amigos, Mulder foge de sua cela e embarca em uma jornada para encontrar o homem que pode ajudar a desvendar a verdade sobre a c
Quando Mulder tenta entrar sem autorização na base militar de Mount Weaver, ele se envolve em uma briga com um supersoldado que acaba morrendo. Mulder é capturado, acusado de assassinato por um tribunal militar e é categoricamente condenado à morte por injeção letal. Mas Skinner, Doggett e Reyes o libertam da prisão e o aconselham a deixar os EUA com Scully. Mulder não quer desistir da bu
Fox Mulder e Dana Scully são abordados por Tad e Malley, popular apresentador de um programa na internet sobre teorias da conspiração, que acredita ter descoberto uma significativa conspiração do governo.
Quando um cientista comete suicídio, Mulder e Scully acreditam que uma força invisível pode tê-lo levado a isso.
Um corpo é encontrado na floresta e Mulder e Scully são chamados para investigar se foi ataque de algum animal ou alguma criatura estranha, segundo as testemunhas.
Mulder e Scully são enviados para investigar o assassinato de um oficial da cidade, no qual nenhum humano poderia ter feito.
Quando uma galeria de arte é bombardeada, Mulder e Scully procuram uma maneira de prevenir um futuro ataque.
O pânico cresce em todo o país a medida que as pessoas começam a ficar gravemente doentes. Enquanto Scully vai em busca da cura em seu interior, Mulder enfrenta o homem que poderia estar por trás de tudo.
Após os surpreendentes últimos acontecimentos, Mulder e Scully percebem que eles não são os únicos que procuram desesperadamente pelo seu filho perdido, William. O destino do mundo depende disso.
Um velho amigo se aproxima de Mulder e Scully de uma maneira aparentemente impossível, revelando assim um segredo assustador.
Uma onda de mortes, em que as vítimas foram atormentadas por seus próprios clones, levam Mulder e Scully a gêmeos que fazem parte de um jogo perigoso.
Explorando a teoria do Efeito Mandela, em que vários grupos de pessoas se lembram de uma versão alternativa da história, Mulder e Scully descobrem como os Arquivos X podem ter sido criados.
Quando duas adolescentes se atacam, porque cada uma acredita que a outra é um monstro, Mulder e Scully descobrem que a sua investigação poderia leva-los até seu filho perdido, William.
Skinner desaparece quando seu passado volta para assombrá-lo. À medida que Mulder e Scully tentam localizá-lo, a desconfiança nele aumenta e atinge seu ápice.
Em um mundo com cada vez mais automação e inteligência artificial, Mulder e Scully se tornam alvo em um jogo mortal de gato e rato.
Mulder e Scully investigam um brutal ataque de animal a um menino em Connecticut, enquanto suspeitam que forças sombrias estejam envolvidas.
Enquanto investigam um caso de roubo de órgãos humanos, Mulder e Scully descobrem uma misteriosa seita com rituais macabros.
Mulder e Scully se apressam para encontrar um foragido William enquanto o Homem Fumante avança com seu plano final.
